Marklkofen befindet sich in Niederbayern, einem Regierungsbezirk des Bundeslandes Bayern. Als Gemeinde im Landkreis Dingolfing-Landau liegt Marklkofen in einer ländlichen Region, die von landwirtschaftlich geprägten Flächen umgeben ist. Ein prägnanter Wirtschaftsfaktor der Gemeinde ist das Volkswagenwerk, das eine herausragende Bedeutung für die regionale Beschäftigung und Wirtschaft hat. Dieses Automobilwerk hat zu einem Ausbau der Infrastruktur geführt, einschließlich erweiterter öffentlicher Verkehrsanbindungen und Straßennetze. Marklkofen zeichnet sich durch eine mittelständisch orientierte Wirtschaftsstruktur aus, wobei neben der Automobilindustrie auch kleinere Handwerksbetriebe und Dienstleistungsunternehmen ansässig sind. Für die Einwohner stehen grundlegende Bildungseinrichtungen wie Kindergärten und eine Grundschule zur Verfügung. Weiterführende Schulen und Fachhochschulen finden sich in den umliegenden größeren Städten. Die Gemeinde verfügt über ein Netz von lokalen Busverbindungen, welches die Anbindung an andere Städte und Gemeinden sicherstellt. Die nähere Umgebung von Marklkofen bietet Freizeit- und Erholungsmöglichkeiten, unter anderem durch die Nähe zum Naturpark Bayerischer Wald.